О разделении пептидов с инвертированными последовательностями

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Экспериментально и теоретически исследовано разделение пептидов с инвертированными от N-конца к C-концу последовательностями. Хотя такие последовательности состоят из одинаковых аминокислотных остатков, их адсорбционные свойства различаются. Теоретический расчет в рамках модели разделения пептидов BioLCCC показал, что разница в адсорбционных свойствах таких последовательностей обусловлена различием в пространственной корреляции связанных в цепь аминокислотных остатков и концевых групп при их взаимодействии с поверхностью.

About the authors

А. В. Горшков

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н. Н. Семенова Российской академии наук

Author for correspondence.
Email: alex.gorshkov@gmail.com
Russian Federation, 119991, Москва, ул. Косыгина, 4

И. Г. Роздина

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н. Н. Семенова Российской академии наук

Email: alex.gorshkov@gmail.com
Russian Federation, 119991, Москва, ул. Косыгина, 4

М. Л. Придатченко

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук

Email: alex.gorshkov@gmail.com

Институт энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе

Russian Federation, 119334, Москва, Ленинский пр., 38

References

  1. Ivanov M.V., Bubis Ju.A., Gorshkov V., Tarasova I.A., Levitsky L.I., Lobas A.A., Solovyeva E.M., Pridatchenko M.L., Kjeldsen F., Gorshkov M.V.// Anal. Сhem. 2020. V. 92. № 6. P. 4326.
  2. Guo D., Mant C.T., Taneja A.K., Parker J.M.R., Hodges R.S. // J. Chromatogr. 1986. V. 359. P. 499.
  3. Mant C.T., Lorne Burke T.W., Black J.A., Hod ges R.S.// J. Chromatogr. 1988. V. 458. P. 193.
  4. Gilar M., Hie H.W., Jaworski A. // Anal Chem. 2010. V. 82. P. 265.
  5. Azarova I.N., Baram G.I., Gol’dberg E.L. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2006. V. 32. № 1. P. 50.
  6. Krokhin O.V., Craig R., Spicer V., Ens W., Stan ding K.G., Beavis R.C., Wilkins J.A. // Mol. Cell Proteom. 2004. V. 3. № 9. P. 908.
  7. Krokhin O.V. // Anal. Chem. 2006. V. 78. № 22. P. 7785.
  8. Reimer J., Spicer V., Krokhin O.V. // J. Chromatogr. A. 2012. V. 1256. P.160.
  9. Palmblad M., Ramström M., Markides K. E., Håkansson P., Bergquist J.// Anal. Chem. 2002. V. 74. P. 5826.
  10. Guan, S., Moran, M. F., Ma, B. // Mol. Cell. Proteom. 2019. V. 18. P. 2099.
  11. Gessulat S., Schmidt T., Zolg D. P., Samaras P., Schnatbaum K., Zerweck J., Knaute T., Rechenber ger J., Delanghe B., Huhmer A., Reimer U., Ehrlich H.-Ch., Aiche S., Kuster B., Wilhelm M. // Nat. Methods 2019. V. 16. P. 509.
  12. Bouwmeester R., Gabriels R., Hulstaert N., Martens L., Degroeve S. // Nat. Methods 2021. V. 18. P. 1363.
  13. Entelis S.G., Evreinov V.V., Gorshkov A.V. // Adv. Polym. Sci. 1986. V. 76. P. 129.
  14. Entelis S.G., Evreinov V.V., Kuzaev A.I. // Reactive Oligomers. Utrecht: VSP, 1989.
  15. Pasch H., Trathnigg B. // HPLC of Polymers. Berlin: Springer, 1999.
  16. Gorshkov A.V., Tarasova I.A., Evreinov V.V., Savits ki M.M., Nielsen M.L., Zubarev R.A., Gorshkov M.V. // Anal. Chem. 2006. V. 78. № 22. P. 7770.
  17. Gorshkov A. V., Evreinov V. V., Tarasova I. A., Gorshkov M. V. // Polymer Science B. 2007. V. 49. № 3–4. P. 93.
  18. Tarasova I. A., Gorshkov A. V., Evreinov V. V., Adams K., Zubarev R. A., Gorshkov M. V. // Polymer Science A. 2008. V. 50. № 3. P. 309
  19. Tarasova I.A., Goloborodko A.A., Perlova T.Y., Pridatchenko M.L., Gorshkov A.V., Evreinov V.V., Ivanov A.R., Gorskov M.V. // Anal. Chem. 2015. V. 87. P. 6562.
  20. Gorshkov A. V., Goloborod’ko A. A., Pridatchen ko M. L., Tarasova I. A., Rozdina I. G.., Evreinov V. V., Gorshkov M. V. // Polymer Science A. 2017. V. 59. № 3. P. 354.
  21. Tarasova I.A., Goloborodko A.A., Perlova T.Y., Pridatchenko M.L., Gorshkov A.V., Evreinov V.V., Ivanov A.R., Gorshkov M.V. // Anal. Chem. 2015 V. 87. P. 6562.
  22. Snyder L.R. // Principles of Adsorption Chromatography. New York: M. Dekker, 1968.
  23. Обухов С. П. // Журн. эксперим. и теорет. физики. 1987. T 93. № 6. С. 1973.
  24. Eisenriegler E., Kremer K., Binder K. // J. Chem. Phys. 1982. V. 77. P. 6296.
  25. Финкельштейн А. В., Птицын О. Б. // Физика белка. М.: Книжный дом Университет, 2012.
  26. MacLean B., Tomazela D. M., Shulman N., Cham bers M., Finney G. L., Frewen B., Kern R., Tabb D. L., Liebler D. C., MacCoss M. J. // Bioinformatics. 2010. V. 26. I. 7. P. 966.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences