О разделении пептидов с инвертированными последовательностями

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Экспериментально и теоретически исследовано разделение пептидов с инвертированными от N-конца к C-концу последовательностями. Хотя такие последовательности состоят из одинаковых аминокислотных остатков, их адсорбционные свойства различаются. Теоретический расчет в рамках модели разделения пептидов BioLCCC показал, что разница в адсорбционных свойствах таких последовательностей обусловлена различием в пространственной корреляции связанных в цепь аминокислотных остатков и концевых групп при их взаимодействии с поверхностью.

Об авторах

А. В. Горшков

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н. Н. Семенова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: alex.gorshkov@gmail.com
Россия, 119991, Москва, ул. Косыгина, 4

И. Г. Роздина

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н. Н. Семенова Российской академии наук

Email: alex.gorshkov@gmail.com
Россия, 119991, Москва, ул. Косыгина, 4

М. Л. Придатченко

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук

Email: alex.gorshkov@gmail.com

Институт энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе

Россия, 119334, Москва, Ленинский пр., 38

Список литературы

  1. Ivanov M.V., Bubis Ju.A., Gorshkov V., Tarasova I.A., Levitsky L.I., Lobas A.A., Solovyeva E.M., Pridatchenko M.L., Kjeldsen F., Gorshkov M.V.// Anal. Сhem. 2020. V. 92. № 6. P. 4326.
  2. Guo D., Mant C.T., Taneja A.K., Parker J.M.R., Hodges R.S. // J. Chromatogr. 1986. V. 359. P. 499.
  3. Mant C.T., Lorne Burke T.W., Black J.A., Hod ges R.S.// J. Chromatogr. 1988. V. 458. P. 193.
  4. Gilar M., Hie H.W., Jaworski A. // Anal Chem. 2010. V. 82. P. 265.
  5. Azarova I.N., Baram G.I., Gol’dberg E.L. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2006. V. 32. № 1. P. 50.
  6. Krokhin O.V., Craig R., Spicer V., Ens W., Stan ding K.G., Beavis R.C., Wilkins J.A. // Mol. Cell Proteom. 2004. V. 3. № 9. P. 908.
  7. Krokhin O.V. // Anal. Chem. 2006. V. 78. № 22. P. 7785.
  8. Reimer J., Spicer V., Krokhin O.V. // J. Chromatogr. A. 2012. V. 1256. P.160.
  9. Palmblad M., Ramström M., Markides K. E., Håkansson P., Bergquist J.// Anal. Chem. 2002. V. 74. P. 5826.
  10. Guan, S., Moran, M. F., Ma, B. // Mol. Cell. Proteom. 2019. V. 18. P. 2099.
  11. Gessulat S., Schmidt T., Zolg D. P., Samaras P., Schnatbaum K., Zerweck J., Knaute T., Rechenber ger J., Delanghe B., Huhmer A., Reimer U., Ehrlich H.-Ch., Aiche S., Kuster B., Wilhelm M. // Nat. Methods 2019. V. 16. P. 509.
  12. Bouwmeester R., Gabriels R., Hulstaert N., Martens L., Degroeve S. // Nat. Methods 2021. V. 18. P. 1363.
  13. Entelis S.G., Evreinov V.V., Gorshkov A.V. // Adv. Polym. Sci. 1986. V. 76. P. 129.
  14. Entelis S.G., Evreinov V.V., Kuzaev A.I. // Reactive Oligomers. Utrecht: VSP, 1989.
  15. Pasch H., Trathnigg B. // HPLC of Polymers. Berlin: Springer, 1999.
  16. Gorshkov A.V., Tarasova I.A., Evreinov V.V., Savits ki M.M., Nielsen M.L., Zubarev R.A., Gorshkov M.V. // Anal. Chem. 2006. V. 78. № 22. P. 7770.
  17. Gorshkov A. V., Evreinov V. V., Tarasova I. A., Gorshkov M. V. // Polymer Science B. 2007. V. 49. № 3–4. P. 93.
  18. Tarasova I. A., Gorshkov A. V., Evreinov V. V., Adams K., Zubarev R. A., Gorshkov M. V. // Polymer Science A. 2008. V. 50. № 3. P. 309
  19. Tarasova I.A., Goloborodko A.A., Perlova T.Y., Pridatchenko M.L., Gorshkov A.V., Evreinov V.V., Ivanov A.R., Gorskov M.V. // Anal. Chem. 2015. V. 87. P. 6562.
  20. Gorshkov A. V., Goloborod’ko A. A., Pridatchen ko M. L., Tarasova I. A., Rozdina I. G.., Evreinov V. V., Gorshkov M. V. // Polymer Science A. 2017. V. 59. № 3. P. 354.
  21. Tarasova I.A., Goloborodko A.A., Perlova T.Y., Pridatchenko M.L., Gorshkov A.V., Evreinov V.V., Ivanov A.R., Gorshkov M.V. // Anal. Chem. 2015 V. 87. P. 6562.
  22. Snyder L.R. // Principles of Adsorption Chromatography. New York: M. Dekker, 1968.
  23. Обухов С. П. // Журн. эксперим. и теорет. физики. 1987. T 93. № 6. С. 1973.
  24. Eisenriegler E., Kremer K., Binder K. // J. Chem. Phys. 1982. V. 77. P. 6296.
  25. Финкельштейн А. В., Птицын О. Б. // Физика белка. М.: Книжный дом Университет, 2012.
  26. MacLean B., Tomazela D. M., Shulman N., Cham bers M., Finney G. L., Frewen B., Kern R., Tabb D. L., Liebler D. C., MacCoss M. J. // Bioinformatics. 2010. V. 26. I. 7. P. 966.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2024