Липид-опосредованное влияние глицирризина на свойства трансмембранного домена E-белка вируса SARS-CoV-2

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В работе исследовано взаимодействие глицирризина с трансмембранным доменом E-белка вируса SARS-CoV-2 (E-protein Trans-Membrane domain (ETM)) в гомогенном водном растворе и в модельной липидной мембране с использованием методов селективного ядерного эффекта Оверхаузера (selective NOESY) и ЯМР-релаксации. Методом селективного NOESY показано наличие взаимодействия глицирризина с ЕТМ в водном растворе, что согласуется с литературными данными моделирования, которые указывают на возможность проникновения молекулы глицирризина внутрь канала, образованного молекулами ETM. Однако данный вывод не подтверждается экспериментами NOESY в модельных липидных мембранах–бицеллах. При этом методом ЯМР-релаксации обнаружено влияние глицирризина на подвижность как липидов, так и молекул ETM в бицеллах. Это позволяет сделать предположение, что глицирризиновая кислота оказывает влияние на активность E-белка коронавируса опосредованно, через липиды.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

П. А. Кононова

Институт химической кинетики и горения им. В.В. Воеводского Сибирского отделения Российской академии наук; Новосибирский государственный университет

Email: olga.gluschenko@gmail.com
Россия, Новосибирск; Новосибирск

О. Ю. Селютина

Институт химической кинетики и горения им. В.В. Воеводского Сибирского отделения Российской академии наук; Институт химии твердого тела и механохимии Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: olga.gluschenko@gmail.com
Россия, Новосибирск; Новосибирск

Н. Э. Поляков

Институт химической кинетики и горения им. В.В. Воеводского Сибирского отделения Российской академии наук; Институт химии твердого тела и механохимии Сибирского отделения Российской академии наук

Email: olga.gluschenko@gmail.com
Россия, Новосибирск; Новосибирск

Список литературы

  1. Baglivo M., Baronio M., Natalini G. et al. // Acta Biomed. 2020. V. 91. № 1. P. 161.
  2. Tang T., Bidon M., Jaimes J.A., Whittaker G.R., Daniel S. // Antiviral Res. 2020. V. 178. P. 104792.
  3. Venkatagopalan P., Daskalova S.M., Lopez L.A., Dolezal K.A., Hogue B.G. // Virology. 2015. V. 478. P. 75.
  4. Schoeman D., Fielding B.C. // Virol. J. 2019. V. 16. № 1. P. 69.
  5. Mehregan A., Pérez-Conesa S., Zhuang Y. et al. // Biochim. Biophys. Acta-Biomembr. 2022. V. 1864. № 10. P. 183994.
  6. Wilson L., Gage P., Ewart G. // Virology. 2006. V. 353. № 2. P. 294.
  7. Gupta M.K., Vemula S., Donde R. et al. // J. Biomol. Struct. Dyn. 2021. V. 39. № 7. P. 2617.
  8. Pervushin K., Tan E., Parthasarathy K. et al. // PLOS Pathog. 2009. V. 5. № 7. P. e1000511.
  9. Chernyshev A. Pre-print. 2020. 10.26434/chemrxiv.12286421.v1
  10. Толстиков Г.А., Балтина Л.А., Гранкина В.П., Кондратенко Р.М., Толстикова Т.Г. Новосибирск: Изд-во “Гео”, 2007.
  11. Shibata S. // Yakugaku Zasshi. 2000. V. 120. № 10. P. 849.
  12. Selyutina O.Y., Polyakov N.E. // Inten. J. Pharm. 2019. V. 559. P. 271.
  13. Fiore C., Eisenhut M., Krausse R. et al. // Phytother. Res. 2008. V. 22. № 2. P. 141.
  14. Sun Z.G., Zhao T.T., Lu N., Yang Y.A., Zhu H.L. // Mini Rev. Med. Chem. 2019. V. 19. № 10. P. 826.
  15. Pompei R., Pani A., Flore O., Marcialis M.A., Loddo B. // Experentia. 1980. V. 36. № 3. P. 304.
  16. Hoever G., Baltina L., Michaelis M. et al. // J. Med. Chem. 2005. V. 48. № 4. P. 1256.
  17. Chrzanowski J., Chrzanowska A., Graboń W. // Phyther. Res. 2021. V. 35. № 2. P. 629.
  18. Bailly C., Vergoten G. // Pharmacol. Ther. 2020. V. 214. P. 107618.
  19. Fomenko V.V., Rudometova N.B., Yarovaya O.I. et al. // Molecules. 2022. V. 27. № 1. P. 295.
  20. Kang H., Lieberman P.M. // J. Virol. 2011. V. 85. № 21. P. 11159.
  21. Sekizawa T., Yanagi K., Itoyama Y. // Acta Virol. 2001. P. 51.
  22. Baba M., Shigeta S. // Antiviral Res. 1987. V. 7. № 2. P. 99.
  23. Lin J.C. // Ibid. 2003. V. 59. № 1. P. 41.
  24. Duan E., Wang D., Fang L. et al. // Ibid. 2015. V. 120. P. 122.
  25. Harada S. // Biochem. J. 2005. V. 392. P. 191.
  26. Crance J.M., Lévêque F., Biziagos E. et al. // Antiviral Res. 1994. V. 23. № 1. P. 63.
  27. Sui X., Yin J., Ren X. // Ibid. 2010. V. 85. № 2. P. 346.
  28. Wolkerstorfer A., Kurz H., Bachhofner N., Szolar O.H.J. // Ibid. 2009. V. 83. № 2. P. 171.
  29. Matsumoto Y., Matsuura T., Aoyagi H. et al. // PLoS One. 2013. V. 8. № 7. P. e68992.
  30. Selyutina O.Y., Shelepova E.A., Paramonova E.D. et al. // Arch. Biochem. Biophys. 2020. V. 686. P. 108368.
  31. Selyutina O.Y., Apanasenko I.E., Kim A.V. et al. // Coll. Surf. B. Biointerfaces. 2016. V. 147. P. 459.
  32. Selyutina O.Y., Apanasenko I.E., Polyakov N.E. // Russ. Chem. Bull. 2015. V. 64. № 7. P. 1555.
  33. Ellena J.F., Lepore L.S., Cafiso D.S. // J. Phys. Chem. 1993. V. 97. № 12. P. 2952.
  34. Lepore L.S., Ellena J.F., Cafiso D.S. // Biophys. J. 1992. V. 61. № 3. P. 767.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Структурная формула глицирризина. Звездочкой отмечен протон, возбуждение которого проводилось в экспериментах sNOESY.

Скачать (59KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Фрагменты спектров 1H-ЯМР для образцов, содержащих 1 мМ ETM (1), 1 мМ ГК и 1 мМ ETM (2), и sNOESY для образца, содержащего 1 мМ ГК и 1 мМ ETM (3) в D2O; pH 3.5.

Скачать (93KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Фрагменты спектров 1H-ЯМР (1) и sNOESY (2) для образца, содержащего 1 мМ ГК в бицеллах ДМФХ/ДГФХ; pH 3.5.

Скачать (70KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Фрагменты спектров 1H-ЯМР (1) и sNOESY (2) для образца, содержащего 0.5 мМ ETM в бицеллах ДМФХ/ДГФХ; pH 3.5.

Скачать (81KB)
Метаданные
6. Рис. 5. Фрагменты спектров 1H-ЯМР (1) и sNOESY (2, 3) для образцов, содержащих 1 мМ ГК (1, 2) и 1 мМ ГК + + 0.5 мМ ETM (3) в бицеллах ДМФХ/ДГФХ; pH 3.5.

Скачать (84KB)
Метаданные

Примечание

Х Международная конференция им. В.В. Воеводского “Физика и химия элементарных химических про­цессов” (сентябрь 2022, Новосибирск, Россия).


© Российская академия наук, 2024